Modele anatomiczne czaszki odgrywają niebagatelną funkcję w edukacji medycznej, badaniach naukowych oraz w praktyce medycznej. Ich znaczenie wynika z konieczności istotnego poznania budowy czaszki, która jest jednym spośród niezwykle złożonych elementów ludzkiego szkieletu. Modele anatomiczne dają one na precyzyjne przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych więzi pomiędzy poszczególnymi składnikami głowy oraz na lepsze zrozumienie mechanizmów urazów, deformacji i patologii. Modele anatomiczne głowy są także szeroko używane w stomatologii. Budowa głowy ma niebagatelne znaczenie w ocenie i leczeniu schorzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w ocenie struktury żuchwy i szczęki, co umożliwia dokładne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są także modele anatomiczne głowy w medycynie sądowej i antropologii. Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem szczegółowości także materiałem wykonania. Jednym spośród znacznie charakterystycznych typów są zwykłe modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające podstawowe kości i ich związania. Modele anatomiczne tego typu są powszechnie używane w szkolnictwie także służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną wersję stanowią modele anatomiczne głowy z ruchomymi elementami, które gwarantują na łatwiejsze zrozumienie połączeń pomiędzy kośćmi oraz procesów ich ruchu, co jest zwłaszcza pomocne w stomatologii i chirurgii szczękowej. W znacznie zaawansowane modele anatomiczne głowy mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co powoduje na dokładne badanie pojedynczych elementów. Dzięki temu można zobaczyć, w jaki sposób poszczególne kości są ze sobą połączone, jakie mają kształty także jakie struktury anatomiczne się na nich znajdują. Tego typu modele anatomiczne są niezwykle przydatne w szkole anatomii i chirurgii, ponieważ dają szczegółową analizę struktur trudnych do zaobserwowania w rzeczywistej czaszce. Kolejnym rodzajem są modele anatomiczne głowy z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w edukacji szczegółowej anatomii. W takich modelach nowe elementy głowy są oznaczone kolorami, co sprzyja ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę głowy mogą być zaznaczone innym odcieniem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób umożliwiający ich zapamiętanie. Jest to wyjątkowo dobre dla uczniów medycyny, którzy muszą opanować trudną terminologię anatomiczną.
Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne głowy z odwzorowanymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego typu modele anatomiczne mają przebieg nerwów czaszkowych oraz naczyń krwionośnych, co jest znacznie cenne w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim można prześledzić ścieżki przebiegu nerwów, ich położenie względem struktur kostnych również miejsca, w jakich mogą być one uciskane lub uszkadzane. Nowa metoda daje też na kształtowanie projektów głowy w technice druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być robione na bazie prawdziwych danych tomograficznych, co powoduje na odwzorowanie indywidualnych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są wyjątkowo przydatne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ dają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie strategii na określonym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Technologia ta jest również używana w rekonstrukcji twarzy w przypadkach urazów oraz deformacji wrodzonych.